2041 год. В результате масштабного прогресса в области кибернетики человечество получило возможность заменять собственные конечности на роботизированные аналоги. Сотрудник 9-го подразделения службы безопасности, майор Мотоко Кусанаги, занимается расследованием деятельности загадочного хакера, известного под именем Кукловод.